tomcat6w.exe ：

1、它是服务管理程序，如果你把tomcat安装成为windows服务，那么用这个可以开始停止或者禁止服务。

2、可视化的界面启动方式，点击start之后即可启动tomcat。

tomcat6.exe ：

1、它是tomcat的服务包装程序，tomcat是java程序，而windows服务则必须是exe程序，这个文件就是当做服务是用的，然后这个文件调用tomcat的java文件 。

2、它是提供dos界面的启动方式，可以查看Tomcat的后台输出